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BiGGEsTS - Biclustering Gene Expression Time-Series

03/01/2007 - 16:00
03/01/2007 - 17:00
Etc/GMT

A ferramenta BiGGEsTS - Biclustering Gene Expression Time-Series, tem como objectivo a integração de algoritmos de biclustering para análise de séries temporais de expressão genética. Estes algoritmos abordam o problema de biclustering em dados provenientes de séries temporais de expressão genética de forma directa, isto é, permitem identificar biclusters formados por um conjunto de genes com expressão coerente num subconjunto contíguo dos instantes temporais em análise. Os biclusters identificados poderão posteriormente ser visualizados e estudados usando a aplicação, e segundo várias dimensões de análise, de forma a identificar aqueles que são relevantes do ponto de vista biológico e podem depois ajudar na identificação de módulos regulatórios. Embora existam já ferramentas que integram algoritmos de biclustering aplicados a dados de expressão genética em geral, o desenvolvimento de uma ferramenta para o caso específico das séries temporais, dada a particularidade dos algoritmos e biclustering integrados e dos resultados obtidos é inovador. Neste seminário será apresentada a versão actual da ferramenta e discutidas direcções para trabalho futuro.